さっきハマったエラーを解決したので、備忘のためのメモです。
RStudioとRの両方で試したのですが、{panelvar}というパッケージをインストールしようとしたら、依存パッケージのコンパイルのエラーがでて進めなくなりました。
最初、Rの古いバージョンでやってたら{progress}というパッケージで躓いたんですが、Rを最新版にアプデしてからやると今度は{vctrs}というパッケージがインストールできてませんでした。
{vctrs}だけをインストールしようとしてもエラーが出る。
ERROR: compilation failed for package ‘vctrs’ * removing ‘/Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.6/Resources/library/vctrs’ Warning in install.packages : installation of package ‘vctrs’ had non-zero exit status The downloaded source packages are in ‘/private/var/folders/7y/j9v534hs3hb971070xnz91l80000gp/T/Rtmp9EalBG/downloaded_packages’
Error: package or namespace load failed for ‘panelvar’:
.onLoad failed in loadNamespace() for 'pillar', details:
call: utils::packageVersion("vctrs")
error: there is no package called ‘vctrs’* installing *source* package ‘vctrs’ ...
** package ‘vctrs’ successfully unpacked and MD5 sums checked
** using staged installation
** libs
clang -I"/Library/Frameworks/R.framework/Resources/include" -DNDEBUG -isysroot /Library/Developer/CommandLineTools/SDKs/MacOSX.sdk -I/usr/local/include -fPIC -Wall -g -O2 -c arg-counter.c -o arg-counter.o
clang: warning: no such sysroot directory: '/Library/Developer/CommandLineTools/SDKs/MacOSX.sdk' [-Wmissing-sysroot]
In file included from arg-counter.c:1:
In file included from ./vctrs.h:2:
/Library/Frameworks/R.framework/Resources/include/R.h:55:11: fatal error: 'stdlib.h' file not found
# include <stdlib.h> /* Not used by R itself, but widely assumed in packages */
^~~~~~~~~~
1 error generated.
make: *** [arg-counter.o] Error 1
ERROR: compilation failed for package ‘vctrs’
* removing ‘/Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.6/Resources/library/vctrs’
Warning in install.packages :
installation of package ‘vctrs’ had non-zero exit status
The downloaded source packages are in
‘/private/var/folders/7y/j9v534hs3hb971070xnz91l80000gp/T/Rtmp9EalBG/downloaded_packages’
これは、こないだのMac OSのアプデ時に、X Code最新化（コマンドラインツールのインストール）しておくべきだったのが原因のようです。
下記のサイトで２段階の解決方法が紹介されてますが、私は１段階目の"xcode-select"で治りました。
_cgo_export.c:3:10: fatal error: 'stdlib.h' file not found の解決方法 - Qiita
